A estrutura de governança do Colégio Israelita é composta pelo Conselho de Administração, Conselho Fiscal e pela Direção Executiva, Pedagógica e Vice-Direção de Educação Judaica, que, juntos, trabalham para garantir o cumprimento da missão e dos valores da instituição, além de promover uma educação de excelência para a comunidade escolar. 

Conselho de Administração
Rafael Prikladnicki (Presidente)
Daniel Matone (1º Vice-Presidente)
Leonardo Caccarelli Wengrover (2º Vice-Presidente)
Eduardo Spunberg (Conselheiro)
Eduardo Zippin Knijniki (Conselheiro)
Fabiane Kahan (Conselheira)
Fernanda Slavutzki (Conselheira)
Fernanda Streck Fernandes (Presidente do Conselho de Pais)
Márcia Horowitz Vieira (Conselheira)
Maria Eduarda Costa Kwitko (Conselheira)
Michel Zavagna Gralha (Conselheiro)
Saulo Pretto Kulkes (Conselheiro)
Victor Daniel Freiberg (Conselheiro)

Conselho Fiscal
Leandro Melnick (Presidente)
Adriane Kiperman (Conselheira)
Fernando Menda Tornaim (Conselheiro)
Gerson Fishmann (Conselheiro)
Márcio Starosta (Conselheiro)
Renato Veisman (Conselheiro)
Ruggero Levy (Conselheiro)

Diretora Executiva
Roseli Jacoby

Diretora Pedagógica
Márcia Beck Terres

Vice-Diretora de Educação Judaica
Ilana Eilberg